
Neposredno nad igralnikom so registri III. manuala, t. i. kontinua, ki je posebej primeren in potreben za izvajanje baročnih vokalno-inštrumentalnih skladb. Takoj za njimi so na isti višini registri I. glavnega manuala. 14 registrov II. manuala je v nadstropju nad glavnim piščaljem »zaprtih« v posebni masivno izdelani omari z dvojnimi stenami. Ta ima spredaj žaluzije, ki omogočajo, da organist med igranjem lahko spreminja glasnost. Pedalni registri so razdeljeni na dva dela (stran C in Cis) in postavljeni na obeh straneh orgelske omare. Nove orgle v veliki dvorani SF so po dispoziciji (izboru registrov) univerzalne orgle, kar pomeni, da omogočajo izvedbo skladb različnih glasbenih stilov od baroka do danes. Povezave med tipkami na igralniku in piščalmi so mehanske, zato pravimo, da imajo orgle mehansko tonsko trakturo. Samo z občutljivo mehansko trakturo, ki je danes standard, more organist vplivati na tone, ki nastajajo v piščalih. Registrska traktura je električna in z možnostjo številnih elektronskih spominov pri kombinacijah, kar je velikega praktičnega pomena, posebno na koncertih.
Nove orgle, opus 61, v veliki dvorani Slovenske filharmonije so za orglami v bližnji frančiškanski cerkvi in v kapeli Zavoda sv. Stanislava v Ljubljani tretji največji inštrument Škofijske orglarske delavnice iz Hoč pri Mariboru. Načrtovanje, postavitev in intoniranje dvoranskih orgel predstavlja posebej zahtevno nalogo. Ljubljana z novimi dvoranskimi orglami v SF dobiva zaokroženo podobo pravega orgelskega mesta. Orgle so simbol in eden izmed bistvenih razpoznavnih znakov evropske civilizacije in kulture. Kot simbol jih je izbrala tudi Academia Philharmonicorum Labacensium. Kot izvemo iz pravil akademije, ni bil namen ljubljanskih filharmonikov »le da se kdaj pa kdaj z ubranim igranjem dostojno razvedrijo, ampak da z igranjem pobožno v spomin pokličejo ono nebeško, ki bo večno trajalo: zato so bile izbrane za akademski simbol orgle device Cecilije, katerih piščali so prijetno sozvočje po zemlji razlivaje vsakogar tudi k nebesom povzdigovale z geslom: POČITEK DAJE, DUHU PA NEMINLJIVOST KAŽE.« Naj tudi nove orgle, ki danes mogočno stojijo pred nami, služijo tej žlahtni viziji.